染色质免疫沉淀反应(CHIP)
染色质免疫沉淀反应(芯片CHIP) 指的是研究细胞中蛋白质和DNA之间相互作用的过程。ChIP是一种用于确定特定蛋白质基因组结合位点的方法,为基因表达的调控提供了宝贵的见解。ChIP涉及到含有特定抗原的染色质部分的选择性富集。识别特定的蛋白质或蛋白质修饰的抗体用于确定抗原在特定位点的相对丰度。
通常用于表征蛋白质- DNA相互作用的技术包括电泳迁移率测定(EMSA)、DNA酶足迹测定和染色质免疫沉淀(ChIP)测定。尽管EMSA是一种快速、灵敏的检测蛋白质- DNA相互作用的方法,它有优点,但它也有局限性,比如样品在电泳过程中不处于化学平衡,而且许多复合物在凝胶中明显比在自由溶液中更稳定。ChIP通过用特异性抗体免疫沉淀染色质来确定这些在体内发生的蛋白质- dna相互作用,ChIP检测最大限度地减少了这些限制,并提供了一种有效的工具。这些分析提供了对细胞外信号或分化和发育过程中发生的染色质变化的公正观察。虽然转录因子结合到启动子是非常动态的,但ChIP分析在研究这些方面提供了一个有效的手段。
在染色质的QC测试中,Qsep1和Qsep100生物片段分析仪是简单易用的CGE仪器。
检测设置:
• 卡夹: S2-0-170612-1
• Alignment marker: 20-15Kb
• 方法: M4-10-04-600
• 缓冲液稀释倍数: 蒋1x dilution buffer两倍稀释
• Marker计算: From 100 bp to 10Kb

图1 DNA Ladder和20 + 15Kb Alignment Marker

图2 使用20+15Kb检测染色质
