次世代定序之跨世代竞合：究竟毛细管电泳于 NGS 扮演什麽关键角色？

究竟 CE 能在 NGS 品管扮演什麽样的角色？

CE 是利用电泳原理将核酸片段进行分离，而由于整个过程都是在毛细管内进行，因此所需样本量很低，电泳时间也可缩短，但却能提供高于一般电泳数十倍的解析度。基于此特性，CE 最常被用在下列 NGS 品管关卡：

1. 分析样本核酸的完整度：纯化后的核酸可透过 CE 确认降解 (degradation) 情形，避免误用高度降解的核酸进行后续核酸片段库的建置。
   
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2.进行样本核酸的定量：儘管核酸定量多使用萤光光谱分析技术，但「眼见为凭」仍有其品管价值，而 CE 的电泳结果图有助于确认实际核酸浓度和萤光光谱分析结果之间是否存在明显误差，尤其是确认核酸片段库是否有接合体双体 (adapter dimer) 存在，光靠定量是无法分辨，进而影响定序资料量。

3.分析核酸片段的长度分布：核酸片段库的製作过程需将样本核酸裁切为特定长度范围内的片段，并进行各种标记和处置以利后续定序。核酸片段库的建置相当费时费工，品质也会直接影响定序结果，因此一般都会在样本核酸裁切、末端修饰、锁定目标区域、及片段放大等步骤后用 CE 各执行一次片段长度分布分析，以确保核酸片段未过度降解、片段长度适中、无引子或其他标记的残留、且没有其他杂质或污染。在此同时也可确认片段长度分布落于定序仪的定序长度限制内，避免有定序不全或伪阴性结果出现。

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